臨床前研究(医学や薬学で新しい物質の有効性や安全性を調べる初期段階の研究)に必要なツールやデータベース(文献検索、ゲノミクス分析、創薬標的の優先順位付け)に接続し、ライフサイエンス分野の初期段階の研究開発を加速します。
Connect to preclinical research tools and databases (literature search, genomics analysis, target prioritization) to accelerate early-stage life sciences R&D
研究機器の出力ファイル(PDF、CSV、Excel、TXT)をAllotrope Simple Model(ASM)(標準化されたデータ形式)のJSON形式または平坦化された2次元CSVに変換します。 次のような場合に使用: 研究者が機器から出たデータを標準形式に統一して、LIMS(実験室情報管理)システムやデータ湖、または後続の分析に備えたいとき。 機器…
nf-coreの生物情報学パイプライン(rnaseq、sarek、atacseq)をシーケンシング(遺伝子配列を読む技術)データに対して実行します。 **次のような場合に使用:** - RNA-seq(遺伝子の発現量を調べる解析)、WGS/WES(全ゲノム配列解析)、ATAC-seq(ゲノムのアクセス可能性を調べる解析)データを分析する場合 - ローカルに…
このスキルは、研究者が以下の場面で活用できます: **使用場面:** - 研究テーマの選定に悩んでいる - プロジェクトのアイデア出しをしたい - 進めている研究が行き詰まっている - 研究に関わる戦略的な判断が必要 - 新しい研究アイデアを検討したい - プロジェクトのリスクを評価したい - 研究戦略を立てる - 複数の選択肢から最適な判断を導き出す -…
scvi-tools を用いた単一細胞解析の深層学習 このスキルは、以下のような場合に使用します: (1) scVI/scANVI による データ統合とバッチ補正(異なるサンプル間の技術的バイアスの除去) (2) PeakVI による ATAC-seq 解析(DNAのアクセス可能性を調べる手法) (3) totalVI による CITE-seq マルチモー…
シングルセル RNA シーケンシング(個別の細胞の遺伝子発現を測定する技術)データ(.h5ad または .h5 形式のファイル)に対して、品質管理を実施します。 MAD(中央絶対偏差、データのばらつきを測る統計値)に基づくフィルタリングと、詳細な可視化グラフを使用して、scverse(生物情報解析の標準的なツールセット)のベストプラクティス(推奨される手法…
バイオ研究環境をセットアップして、利用可能なツールを探索します。 次のような場合に使用: - プラグインの使い始めで全体の仕組みを把握したいとき - 接続されている文献検索、創薬支援、データ可視化(グラフ化など)のMCPサーバーを確認したいとき - 新しいプロジェクトを始める前に、利用できる分析スキルを一覧で調べたいとき
原文・著作権は Anthropic および各プラグイン作者に帰属します。日本語訳は Claude API による自動翻訳です。